PCR (Polymerase Chain Reaction) blir brukt som et diagnostikkverktøy for å identifisere tilstedeværelse av sykdomsfremkallende agens (virus, bakterier og parasitter), samt genetiske mutasjoner fra vevsprøver, slim, rognvæske, vann og andre miljøprøver.
PCR er en analyseteknikk som påviser sekvenser av arvestoff (DNA, RNA) i prøvemateriale. Teknikken baserer seg på repeterende temperatur-sykluser med oppformering av en målsekvens som er spesifikk for ønsket agens som resultat.
Sanntids-PCR (eng. Real-time) er en variant av PCR-teknikken. I sanntids-PCR blir antallet temperatursykluser som skal til for å påvise en målsekvens brukt for å generere prøvesvaret. Dette blir kalt for en Ct-verdi. Lav Ct-verdi indikerer større mengde av målsekvensen i prøvematerialet.
Sanntids-PCR som metode er semikvantitativ og Ct-verdier er kun veiledende for mengde målsekvens i prøvematerialet. Våre resultater fra sanntids-PCR blir rapportert kvalitativt, dvs som påvist eller ikke påvist agens. Vi oppgir imidlertid også Ct-verdien som danner grunnlaget for det kvalitative svaret.
Produktliste for PCR-analyser
Vi utfører følgende analyser for å påvise agens (virus, bakterier og parasitter) i egnede vev fra ulike fiskearter:
Atlantisk laks
Aeromonas salmonicida
Bakteriesykdom: Furunkulose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Branchiomonas cysticola
Bakteriesykdom: Epiteliocystis
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle
Akkreditert analyse: Nei
Flavobacterium psychrophilum
Bakteriesykdom: Systemisk flavobakteriose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre, gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Infeksiøs lakseanemivirus (ILAV)(ISAV)
Virussykdom: Infeksiøs lakseanemi (ILA) (engelsk: ISA)
Blue Analytics benytter egenutviklede ILAV- sekvenseringsassay for verifisering av eventuell HPR-delesjon og virulensmarkør i prøvemateriale med lav virusmengde.
Offentlig utpekt laboratorium for analysen: Ja
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte, nyre
Akkreditert analyse: Ja
Infeksiøs lakseanemivirus HPR0 (ILAV HPR0) (ISAV HPR0)
Avirulent variant av infeksiøs lakseanemi (ILA)-viruset (engelsk: ISA-virus). Kan mutere til virulent virusvariant og forårsake sykdom.
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle, slim (bruk eventuelt svaber)
Akkreditert analyse: Nei
Infeksiøs pankreasnekrosevirus (IPNV)
Virussykdom: Infeksiøs pankreasnekrose (IPN)
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Ja
Moritella viscosa
Bakteriesykdom: Vintersår
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Paramoeba perurans
Parasittsykdom: Amøbe gjellesykdom (AGD)
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber)
Akkreditert analyse: Nei
Paranucleospora theridon
Parasittsykdom: «Høstsyke» (mikrosporidiose)
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle
Akkreditert analyse: Nei
Pasteurella atlantica genomovar salmonicida
Bakteriesykdom: Pasteurellose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Piscint myokardittvirus (PMCV)
Virussykdom: Kardiomyopatisyndrom (CMS)
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte, nyre
Akkreditert analyse: Nei
Piscint orthoreovirus 1 (PRV1)
Virussykdom: Hjerte- og skjelettmuskelbetennelse (HSMB)
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte
Akkreditert analyse: Nei
Renibacterium salmoninarum
Bakteriesykdom: Bakteriell nyresykdom (BKD)
Offentlig utpekt laboratorium for analysen: Ja
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Ja
Salmonid Alfavirus (SAV)
Virussykdom: Pankreassykdom (PD)
Blue Analytics kan sekvensere SAV for å differensiere mellom SAV2 og SAV3.
Offentlig utpekt laboratorium for analysen: Ja
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte, nyre
Akkreditert analyse: Ja
Salmonid Alfavirus 2 (SAV2)
Virussykdom: Pankreassykdom (PD)
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte, nyre
Akkreditert analyse: Nei
Salmon Gill Poxvirus (SGPV)
Virussykdom: Laksepox
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum finmarkense disentrarchi
Bakteriesykdom: Tenacibaculose
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum finnmarkense finnmarkense
Bakteriesykdom: Tenacibaculose
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum finnmarkense ulcerans
Bakteriesykdom: Tenacibaculose
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum maritimum
Bakteriesykdom: Tenacibaculose, assosiert med sårdannelse
Egnet vev for prøvetaking: Hud med sår (bruk eventuelt svaber i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Yersinia ruckeri
Bakteriesykdom: Yersiniose (Rødmunnsyke)
Blue Analytics benytter egenutviklet test for å skille virulente clonal complex 1 yersinia fra miljøstamme.
Egnet vev for prøvetaking: Nyre.
Akkreditert analyse: Nei
Regnbueørret
Aeromonas salmonicida
Bakteriesykdom: Furunkulose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Branchiomonas cysticola
Bakteriesykdom: Epiteliocystis
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle
Akkreditert analyse: Nei
Flavobacterium psychrophilum
Bakteriesykdom: Systemisk flavobakteriose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre, milt
Akkreditert analyse: Nei
Infeksiøs pankreasnekrosevirus (IPNV)
Virussykdom: Infeksiøs pankreasnekrose (IPN)
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Ja
Moritella viscosa
Bakteriesykdom: Vintersår
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Paramoeba perurans
Paranucleospora theridon
Paranucleospora theridon
Piscint orthoreovirus 3 (PRV3) (Virus Y)
Virussykdom: Hjerte- og skjelettmuskelbetennelse (HSMB)-lignende
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte
Akkreditert analyse: Nei
Renibacterium salmoninarum
Bakteriesykdom: Bakteriell nyresykdom (BKD)
Offentlig utpekt laboratorium for analysen: Ja
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Ja
Salmonid Alfavirus (SAV)
Virussykdom: Pankreassykdom (PD)
Blue Analytics kan sekvensere SAV for å differensiere mellom SAV2 og SAV3.
Offentlig utpekt laboratorium for analysen: Ja
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte, nyre
Akkreditert analyse: Ja
Salmonid Alfavirus 2 (SAV2)
Virussykdom: Pankreassykdom (PD)
Egnet vev for prøvetaking: Hjerte, nyre
Akkreditert analyse: Nei
Salmoxcellia vastator
Parasittsykdom: Infeksjon med encellet organisme (protist)
Egnet vev for prøvetaking: Nyre, lever
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum finnmarkense disentrarchi
Bakteriesykdom: Tenacibaculose
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum finnmarkense finnmarkense
Bakteriesykdom: Tenacibaculose
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum finnmarkense ulcerans
Bakteriesykdom: Tenacibaculose
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Tenacibaculum maritimum
Bakteriesykdom: Tenacibaculose, assosiert med sårdannelse
Egnet vev for prøvetaking: Hud med sår (bruk eventuelt svaber til avskrap av hud i sårkant)
Akkreditert analyse: Nei
Yersinia ruckeri
Bakteriesykdom: Yersiniose (Rødmunnsykke)
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Kveite
Reovirus 7
Virussykdom: Atlantic halibut reovirus (AHRV)
Egnet vev for prøvetaking: Lever
Akkreditert analyse: Nei
Rognkjeks
Aeromonas salmonicida
Bakteriesykdom: Furunkulose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Aeromonas salmonicida type V
Bakteriesykdom: Atypisk furunkulose
Den vanligste varianten er genotype VI, men alle genotypene I-VI har blitt knyttet til sykdom hos rognkjeks.
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Aeromonas salmonicida type VI
Bakteriesykdom: Atypisk furunkulose
Den vanligste varianten er genotype VI, men alle genotypene I-VI har blitt knyttet til sykdom hos rognkjeks.
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Moritella viscosa
Bakteriesykdom: Vintersår
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Paramoeba perurans
Parasittsykdom: Amøbe gjellesykdom (AGD)
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber)
Akkreditert analyse: Nei
Leppefisk
Aeromonas salmonicida
Bakteriesykdom: Furunkulose
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Aeromonas salmonicida type V
Bakteriesykdom: Atypisk furunkulose
Den vanligste varianten er genotype VI, men alle genotypene I-VI har blitt knyttet til sykdom hos leppefisk.
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Aeromonas salmonicida type VI
Bakteriesykdom: Atypisk furunkulose
Den vanligste varianten er genotype VI, men alle genotypene I-VI har blitt knyttet til sykdom hos leppefisk.
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Moritella viscosa
Bakteriesykdom: Vintersår
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Paramoeba perurans
Parasittsykdom: Amøbe gjellesykdom (AGD)
Egnet vev for prøvetaking: Gjelle (bruk eventuelt svaber)
Akkreditert analyse: Nei
Tilapia
Infeksiøs milt- og nyrenekrose virus (ISKNV)
Virussykdom: Infeksiøs milt- og nyrenekrose
Egnet vev for prøvetaking: Milt, nyre, lever
Akkreditert analyse: Nei
Red Seabream Iridovirus (RSIV)
Virussykdom: Red seabream iridiovirusinfeksjon
Egnet vev for prøvetaking: Nyre
Akkreditert analyse: Nei
Tilapia lake virus (TiLV)
Virussykdom: Tilapia ferskvanns-virusinfeksjon
Egnet vev for prøvetaking: Hjerne, øye, lever
Akkreditert analyse: Nei
Ta kontakt hvis du ikke fant den analysen du lette etter. Vi kan ofte imøtekomme behov for andre analyser enn det som står oppført i oversikten.